Como converter GR ou GT em FA de clientes intracomunitários   

Ao converter ou transformar uma guia de remessa/transporte de um cliente estrangeiro aparece uma mensagem de erro ao gravar a fatura.
A mensagem indica que a GR em questão deverá ser comunicada á AT antes de ser transformada ou convertida..
Ora as guias de remessa/transporte para clientes estrangeiros não necessitam de código AT, como é que posso ultrapassar este problema ou qual o melhor método a seguir para eu puder ter a rastreabilidade de uma GR/GT passada para Fatura.